Dans des milieux équilibrés, les destructeurs ont suffisamment d'oxygène pour décomposer la biomasse - les matières organiques représentent la plus grande part de volume dans les sédiments - nous recommandons le traitement pour réduire le volume autour de 10% de perte au feu de la matière sèche.

La biomasse organique morte forme des boues sombres au fond de l'eau, ce qui entraîne un manque d'oxygène. Il en résulte des gaz de décomposition toxiques. Une aération douce modifie le milieu: les microbactéries aérobies sont attirées, métabolisent les matières organiques et fixent les substances nocives sur les sédiments.

L'aération continue permet de créer un milieu aérobie continu et de dégrader en permanence les boues. Le nitrate issu de la nitrification peut maintenir le milieu aérobie en tant que donneur d'oxygène. C'est là qu'a lieu la dégradation plus poussée du nitrate en azote. Dans le milieu aérobie, les composés phosphorés sont durablement retenus.